NGS関連ツール:リキッドバイオプシー

NGS関連ツール:リキッドバイオプシー cfDNAライブラリ
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次世代シーケンサー、エクソーム、ctDNA、cfDNA、FFPE、メチレーション がんバリアントの包括的な検出。

Twist cfDNA Pan-cancer Reference Standardで高性能のアッセイ開発が可能に。
Twist cfDNAライブラリ調製キットを用いてセルフリーDNAから低頻度の体細胞変異を高感度に同定。

合成コントロール cfDNAコントロール ctDNAコントロール UMI 分子バーコード

 

お客様の声

体細胞変異の低頻度バリアントを信頼性高く検出する検出系を構築中です。

私たちは固形臓器に蓄積する遺伝子変異のゲノム解析を進めており、体細胞変異の低頻度バリアントを信頼性高く検出する検出系を構築中です。今回、Twist cfDNA Library調製キットを用いることで、微量(1.5ng)の断片化DNAから、PCRサイクル数を1サイクル減らしても従来法に匹敵するライブラリ収量が得られるだけでなく、既存のターゲットキャプチャシーケンスの平均カバレッジを分子バーコード処理後に30%程度高めることが可能であることが分かりました。Twistのライゲーション処理は簡便で短時間にライブラリ調製が可能であり、分子バーコードを用いた微量系のアプリケーションの広がりが期待されます。

京都大学 医学研究科 腫瘍生物学講座 特定准教授 垣内伸之

仕様

技術資料
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  • New! ガイド:Twist UMI Design Overview and Usage Guidelines​​(Rev1)
  • テクニカルノート:Processing Sequencing Data Utilizing Twist Unique Molecular Identifier (UMI) Adapter System​​(Rev1)
  • テクニカルノート:cfDNA Library Prep Kit Datasheet​​(UMIファミリーサイズのフィルタ設定など)
  • 実験に必要なものリスト
    • ライブラリ調製:Twist cfDNA Library Preparation with the Twist UMI Adapter System(Rev1:日本語)
    • ターゲットキャプチャ:Twist cfDNA Target EnrichmentStandard Hybridization Protocol​​(Rev1:日本語)

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    価格/ウェビナー

    • 国内代理店は下記となります。
      • アズワン株式会社(お問い合わせ:i7001-37@so.as-1.co.jp)
      • 住商ファーマインターナショナル株式会社(お問い合わせ:info@summitpharma.co.jp)
    ウェビナー cfDNA
    複数のがんの検出を可能にする DNAメチル化に基づくリキッドバイオプシー 中国企業AnchorDx Medical Co. Ltd.で実施された、Twist Methylation Panelを用いた cfDNA メチル化分析による複数の消化器系がんの検出についてご紹介します。
    早期がん検出の感度を向上させるcfDNAのターゲットエピゲノム配列決定 Targeted Epigenome Sequencing of cfDNA to Improve Sensitivity for Early Cancer Detection:ケンブリッジ大学で評価されたcfDNA分析(NEB-to-Twistのワークフローの優位性、パネルの堅牢性、パフォーマンスなど)について示して頂いております
    Enabling disease specific research using dynamic targeted sequencing:Broad研究所が開発したcfDNAのターゲットエンリッチメントのワークフローについてご紹介します。

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